都说益生菌菌株的是有特异性的，其实安全性也一样，幼儿益生菌所采用的菌株应通过全基因组测序，不携带任何不良基因，这样使用安全才有保障。幼儿益生菌产品，专业可靠是关键。
益生菌菌株的安全性评估应基于全基因组测序：
益生菌菌株是否携带耐药基因；
益生菌菌株是否含有致病性基因；
益生菌菌株是否携带环境抗性基因。
动物双歧杆菌Bb-12和鼠李糖乳杆菌LGG分别于2004年和2009年完成全基因组测序，分别保藏于德国微生物及细胞保藏中心（DSM）和美国典型菌种保藏中心（ATCC）。鼠李糖乳杆菌HN001和乳双歧杆菌HN019则存放于澳大利亚化学分析实验室（AGAL）。
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